芯片技术用于APC基因启动子甲基化定量检测
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Q789

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江苏省政府“135”重点实验室科研基金(SK200205),诊断心肌疾病的生物芯片研制与应用(BG2003033)。


Analysis of methylation profiles of APC gene promotor in lung cancer by methylation-specific microarray
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    目的研制抑癌基因APC启动子1A的甲基化定量检测芯片,对临床标本进行初步定量检测分析。方法采用脐带血DNA克隆体作为阴性、阳性质控品建立芯片,提取6例健康人的肺组织DNA、6例肺癌患者的肺组织和癌组织DNA,进行亚硫酸盐化学修饰,以甲基化特异性引物进行基因扩增,与探针杂交检测,并进行甲基化特异性序列分析。结果甲基化阳性、阴性质控品的芯片检测与测序结果吻合。687、707、714、719和726共5个位点的荧光强度标准曲线的R2为0.93-0.99。687、707、714、719和726共5个位点非甲基化的检测范围:(0±8.7)%、(0±17.6)%、(0±17)%、(0±13)%、(0±8)%;甲基化杂合型的检测范围:(50±3.6)%、(50±6.9)%、(50±3.5)%、(50±8.5)%、(50±7.3)%。标本的芯片检测与测序结果一致。结论本研究首次建立了以微阵列技术为基础的APC基因启动子甲基化定量检测芯片。

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引用本文

王贤 潘世扬 陆祖宏 程璐 魏源华 张丽霞 陈丹 张寄南.芯片技术用于APC基因启动子甲基化定量检测[J].临床检验杂志,2006,(3):199-202

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