野生型RhD与亚洲型Del共有特异性抗原表位的生物信息学预测
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深圳市南山区卫生科技项目(NS2023132);深圳市血液中心科研课题(SZBC202410)


Bioinformatic Prediction of Common Specific Epitopes between Wild-Type RhD and Asian-Type Del
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    摘要:目的 筛选野生型RhD与亚洲型Del(RHD 1227A)的共有特异性抗原表位。方法 对63份RhD阳性样本进行mRNA测序,获得优势剪接体;利用DeepTMHMM、DNAStar、BepiPred 3.0、ABCpred、DiscoTope 3.0等生物信息学工具,对比RHD 1227A剪接体的氨基酸序列差异,预测跨膜结构、二级结构及潜在抗原表位,交叉验证共有RhD特异性表位。结果 野生型RhD阳性样本存在3种优势剪接体(全长、缺失Exon 7、缺失Exon 7/8/9),对比分析后发现,野生型和RHD 1227A剪接体的胞外区2 LSQFPSGKVVITLF和胞外区4 RSPIERKNA为RhD特异性共有序列。抗原表位预测显示:线性表位229RSPIERK235和构象表位102PS103、231PIE233在所有剪接体中高度保守,多位于无规卷曲结构且暴露于胞外区。结论 预测出野生型RhD与亚洲型Del的共有RhD特异性抗原线性和构象表位,可作为Del型筛查的诊断靶点,为开发高效检测技术提供关键依据。

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引用本文

刘瑞琪,吴伟鑫,孙晓琳,刘海云,李璐,魏俊杰,张印则.野生型RhD与亚洲型Del共有特异性抗原表位的生物信息学预测[J].临床检验杂志,2026,44(05):377-384

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  • 收稿日期:2025-06-04
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