2024, 42(05):321-326.
摘要:摘要:目的﹑检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点,种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PCR法检测arpA ,chuA ,yjaA 、T'spE4C2 、ArpAgpE和trpAgpC基因以确定细菌的种系分型;采用多重PCR法检测毒力基因iutA fimHl fyuA ,.kpsMT'Ⅱl .cnfl cxac ,hlyA ,traT kpsMT Ⅲ和PAl;使用卡方检验分析种系分型之间的耐药率及毒力基因分布差异。结果270株血培养大肠埃希菌对头孢曲松,复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦,头孢唑林和环丙沙星的耐药率较高,均大于50.0%;对亚胺培南,厄他培南,阿米卡星和哌拉西林/他唑巴坦的敏感性较高,耐药率均低于5.0%。在种系分型方面,最常见的型别是B2型和D型,分别占总数的38.0%和16.2% ,而E型和隐分支I型占比<1.0% ,较为少见。毒力基因分析发现,fimH和fyuA基因的分布率最高,均在99.0%以上, 而 hpsMTⅢ、hlyA和cvalC3种基因的分布率较低,均低于20.0%。卡方检验显示,毒力基因iutA fimHl fyuA ,krsMTl,cnfl PAI在B型的分布显著高于非B2型(P<0.05) ,且B2型携带的iutA fyuA ,kpsMT Ⅱ cnfl PAI基因显著高于D型(P<0.05)。结论―在治疗引起血流感染的大肠埃希菌时,应慎用头孢曲松、复方新诺明,氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦,头孢唑林和环丙沙星等药物。血流感染的大肠埃希菌为B2型时,应同时进行中段尿培养以确认感染源并监测治疗的成功率。
2024, 42(05):327-331.
摘要:摘要:目的﹐分析多黏菌素耐药大肠埃希菌的耐药机制、药敏特点及其同源性,为有效预防和控制其暴发及流行提供分子流行病学依据。方法收集2016年5月至2022年6月分离自临床的多黏菌素耐药大肠埃希菌,应用PCR技术筛选移动性多黏菌素耐药基因(mobile colistin resistance ,MCR) ,采用微量肉汤稀释法测定最小抑菌浓度。收集患者的临床资料,利用脉冲场电泳技术(PFGE)对收集到的菌株进行同源性分析并对其中Ⅰ株进行全基因组测序分析。结果﹐分离并鉴定出4株携带有MCR-I基因的多黏菌素耐药大肠埃希菌,4株菌株除了对替加环素均敏感外,对于临床常见的绝大多数抗生素均表现出不同程度的耐药。临床资料分析均未发现患者有多黏菌素使用史。该4株菌可分为2种类型,其中A型3株,B型1株。对其中1株菌进行全基因组测序分析发现MCR-I基因位于约70 kb的质粒上。结论﹐携带MCR-I基因的多黏菌素耐药大肠埃希菌具有克隆传播的潜在威胁,对临床常见抗生素均表现出较高的耐药性,为临床治疗带来极为严重的挑战,需要加强防护措施,防止其暴发流行。
2024, 42(05):332-336.
摘要:摘要:目的―探讨急诊重症监护室( emergency intensive care unit,EICU)血流感染患者临床结局的风险因子,为临床决策提供依据。方法﹐回顾性收集2019年1月至2023年4月我院就诊的141例EICU血流感染患者的病历资料及血培养记录,采用Logistic回归分析患者死亡的危险因素,运用Cox回归分析上述因素与患者生存时间和临床结局的关系。结果 在 141例EICU血流感染患者中,两种及以上细菌混合血流感染[比值比(OR)=5.68,95%置信区间(CI) ;1.20~26.98,P<0.05]及多重耐药菌血流感染(OR=6.39,95%CI;2.78~14.67,P<0.01)与患者死亡具有显著相关性;是否根据药敏结果及时调整用药[风险比(HR)=0.47,95%C1 ,0.30~0.74]和多重耐药菌血流感染(HR=2.02,95%C1;1.28~3.20)是EICU血流感染患者死亡的风险因子(P<0.01)。结论﹐尽早采集血培养,明确感染病原菌,精准用药控制感染,可以有效降低患者的死亡率。
2024, 42(05):337-342.
摘要:摘要:目的 采用生物信息学和实时荧光定量PCR(qgRT-PCR)筛选并验证对食管癌(ESCA)发生和发展起关键作用的基因,以期寻找ESCA的新型生物学标志物。方法﹐检索TCCA数据库,利用韦恩图分析,初步确定ESCA样本中差异表达基因与对无病生存率(DFS)产生最显著影响的基因之间的交又基因。通过对重叠基因进行蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络分析,并进行GO和KEGC功能分析,筛选出与ESCA发生,发展相关的关键潜在基因。利用qRT-PCR对ESCA患者外周血中关键基因mRNA 的表达水平进行定量分析并结合患者临床病理参数进行统计学分析,以评估其作为ESCA新型生物学标志物的潜在价值。结果在TCCA数据库中筛选出的ESCA差异表达基因与无病生存基因交叉后,发现存在明显差异表达的基因59个,其中39个基因上调,20个基因下调,且上述基因均明显影响患者的 DFS。经过PPI网络分析后,确定了15个核心互作的上调基因,而下调基因没有形成任何互作网络。进一步对这15个核心互作基因通过CO和KECC富集分析,发现纤维连接蛋白1(FN1)可能是ESCA筛查的潜在生物学标志物。qRT-PCR结果显示,与健康人对照组相比,ESCA患者外周血中FNVl mRNA的表达水平显著升高。结合患者的临床病理参数分析,发现分化程度差、临床病理分期高的ESCA患者外周血FNl mRNA水平明显升高,且证实FNl mRNA水平模型能够有效区分食管癌患者和健康人。结论FNI mRNA可作为ESCA潜在的非侵入性筛查生物学标志物。
2024, 42(05):343-347.
摘要:摘要:目的﹑探究降钙素原(PCT),白细胞介素6(IL-6),肝素结合蛋白(HBP)和C反应蛋白(CRP)对脑梗死合并肺部感染的预测价值。方法选取2022年7月至2023年6月于南京医科大学附属江宁医院就诊的145例脑梗死患者作为脑梗死组,根据其是否并发肺部感染分为合并感染组(76例)和单纯脑梗死组(69例)。另选取同期于该院进行体检的健康人群61例作为健康人对照组。收集各组一般临床资料,检测并比较血清生化指标。采用Ingistic 回归分析法进行脑梗死合并肺部感染的危险因素分析。绘制ROC曲线,使用ROC曲线下面积(AUC"")评估各个指标对脑梗死合并肺部感染的诊断价值。结果﹐年龄,PCT,IL-6,HBP 和CRP是脑梗死并发肺部感染的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析表明,PCT,JIl-6,HBP和CRP对预测脑梗死合并肺部感染均有一定的临床价值,四项联合预测的敏感性和特异性分别为85.47%和75.36% ,均高于PCT,JLl-6HBP和CRP单独预测(P<0.05)。结论血清PCT,ILl-6,HBP和CRP在脑梗死并发肺部感染患者血清中呈高表达,四者均可作为脑梗死合并肺部感染的诊断指标,且四项联合检测可有效提高诊断的准确性。
2024, 42(05):348-351.
摘要:摘要:目的―探讨获得性巨细胞病毒感染在超早产儿中的临床应用价值。方法―回顾性分析本院新生儿科2023年7月1日至9月15日送检的1072例新生儿血清样本的巨细胞病毒相关抗体检测结果。结果1072例样本中有2例患儿确诊获得性巨细胞病毒感染。该2例患儿均为超早产儿(胎龄24-~-27周),超低出生体重儿(750~999 g),均以血小板降低为首发表现,1例为输血获得性巨细胞病毒感染,另1例为母乳获得性巨细胞病毒感染。结论﹐在超早产儿这类特殊人群中,输血治疗时需警惕输血获得性巨细胞病毒感染,同时也要谨防母乳获得性巨细胞病毒感染,必要时经巴氏消毒后再喂养。
2024, 42(05):352-355.
摘要:摘要:目的﹐检测原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的自身抗体水平,并探讨抗线粒体抗体量值水平在PBC诊断中的临床应用价值。方法﹐收集2015年3月至202年11月济宁医学院附属医院就诊的PBC患者110例,肝脏疾病对照(包括病毒性肝炎和自身免疫性肝炎)患者80例,结缔组织病(CTD)患者75例以及体检健康者90例,采集各组血清样本,采用间接免疫荧光法(IFA)、ELISA法和化学发光法(CLIA)分别检测各组血清抗线粒体抗体(AMA ) ,抗线粒体M2抗体(AMA-M2),抗 gp210抗体( anti-gp210)和抗sp100抗体( anti-sp1l00)的表达水平,并比较不同抗体量值水平在各组中的差异。采用Kappa检验分析CLA法和ELISA法检测AMA-M2的一致性,并用ROC曲线评估两种方法对PBC的诊断效能。结果IFA法检测结果表明,72.7%的PBC患者AMA水平为中高滴度(≥1∶160),与其他肝脏疾病组相比差异具有统计学意义(X=76.37,P<0.01)。PBC患者AMA-M2呈高水平状态(253.1±159.6 RU/mL) ,与其他肝脏疾病组相比差异亦具有统计学意义(U= 10.93,P<0.01)。CLIA法和ELISA法检测AMA-M2一致性的Kappa值为0.637(P<0.05)。ROC曲线结果显示,CLA法检测AMA-M2水平诊断PBC的ROC曲线下面积(AUCO")为0.940(95% C1 ,0.915~0.965,P<0.01 ) , ELISA法检测AMA-M2水平诊断PBC的AUC"为0.907(959%C1;0.864~0.950,P<0.01)。结论―AMA量值水平检测有助于提高PBC的诊断准确性,应高度重视AMA滴度以及AMA-M2的定量检测。
2024, 42(05):356-359.
摘要:摘要:慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia ,CLL)是一种常见的致命性恶性血液病。由于CLL的病理性质复杂多样,其诊断与治疗监测在临床上一直被视为棘手的问题。随着分子诊断技术的进步,针对染色体异常,基因突变及融合等方向的诊断技术已逐步应用于临床诊疗过程,有力推动了CLL诊断的进展,使一些新的靶点,如淋巴细胞增强结合因子1(lymphoidl enhancer binding factor 1,LEF1),T细胞受体相关蛋白激酶70Zeta链(zreta chain of T cell receptor associated protein ki-nase 70,ZAP70)等广泛应用于CLL与淋巴瘤的鉴别诊断及其预后判断。鉴于近期在CLL领域取得的多项突破性研究进展,有必要对目前有关CLL分子机制,诊断以及预后评估的生物学标志物进行全面总结和分析。该文旨在介绍有关CLL分子诊断方法的最新报道,并着重阐明了可能应用于分子诊断技术的新靶点以及在临床辅助诊断、耐药性监测和预后判断等方面值得进一步研究的领域。
2024, 42(05):360-362.
摘要:摘要:检验医师规范化培训是培养检验医师的重要途径。其中,临床徵生物学检验作为紧密结合临床的检验亚专业学科,临床微生物学检验医师应具备专业的临床思维、扎实的理论知识和检验操作技能以及良好的实验室沟通能力。该文探讨了临床微生物检验专业在检验医师规范化培训中的经验与体会,以研究型学科建设为契机,设立培养目标,并合理分配培养时间,在检验医学科住院医师规范化培训结业理论考核大纲的指导下,制定理论教学课程、临床技能教学课程和临床实践。同时,采用线上,线下相结合的教学方法,实施理论与技能双考核的教学模式,为培养具有特色的高质量临床微生物学检验医师提供教学参考。
2024, 42(05):363-369.
摘要:摘要:目的﹑评估平均核苷酸相似度(average nucleotide idenity,ANI)和16S rDNA技术对沙门氏菌的鉴定能力。方法﹐从GenBank数据库批量下载全球沙门氏菌基因组和相应血清型,以沙门氏菌典型菌株的基因组作为分型菌株。利用fastANI软件,根据默认参数进行ANI分析。使用在线软件SpeciesFinder针对细菌的16S rDNA进行物种和血清型鉴定。结果﹐在下载的2306个基因组中,1 767株沙门氏菌存在178种血清型,以鼠伤寒沙门菌323株(18.3%)和肠炎沙门菌300株(17.0%)最为常见。ANI分析显示,以95%为界值时,仅有30株(1.3%)沙门氏菌被分配到1个特定的亚种,其余2.276株(98.7%)沙门氏菌均可分配到2~5个亚种;以97%为界值时,2306株(100%)沙门氏菌均可被鉴定到唯一的亚种。基于16 rDNA的分析仅鉴定出1072株(46.5%)沙门氏菌,其中95.2%(1 021/1072)的沙门氏菌鉴定的亚种结果与ANI(≥97%)分析鉴定的结果完全一致;与已知的血清型相比,仅有2.4%(19/784)的沙门氏菌与已知的血清型结果一致。结论ANI更适合沙门氏菌的种及亚种鉴定,ANI≥97%可作为沙门氏菌亚种的鉴定标准。16S rDNA技术对于沙门氏菌鉴定的敏感性尚有待提高。
2024, 42(05):370-376.
摘要:摘要:目的提升来源于IS200/IS605转座子家族的RNA引导的核酸内切酶OgeulscB的基因编辑效率。方法﹐利用OgeulscB蛋白已解析的晶体结构,计算氨基酸与核酸之间的原子距离,将距离小于10月的非正电荷氨基酸残基突变为精氨酸( argi-nine,R)以提高OgeulscB与核酸的亲和力,通过人胚肾293T细胞内源性位点验证不同突变体的基因编辑效率。结果经过两轮迭代突变,发现Q376R-S456R和A401R-S456R这2个双突变体在不同细胞系的多个内源性位点上均能显著提升OgeulscB的基因编辑效率。结论 基于结构对OgeulscB蛋白进行理性蛋白质工程化改造,能够提升OgeulscB核酸内切酶活性,为将其作为一种有效的基因编辑工具提供了实验依据。
2024, 42(05):377-383.
摘要:摘要:目的﹑对一起甲型和乙型副伤寒同时暴发流行事件中菌株的分子分型,毒力及耐药特征进行分析,为不同型别副伤寒同时传播的防治提供参考依据。方法―回顾分析2018年9月至11月新疆生产建设兵团医院就诊的副伤寒确诊病例31例。对分离菌株进行血清学分型及药物敏感试验,采用多重PCR,脉冲场凝胶电泳、多位点序列分析进行分子分型,并检测毒力基因及耐药基因。结果31例确诊病例共分离出32株副伤寒沙门菌,血清学分型分为甲型19株,乙型13株,所有菌株对环丙沙星中介率为100%。11株代表菌株的M-PCR分子分型与血清学分型结果一致;甲型与乙型副伤寒沙门菌的 PFCE指纹图谱均一致;甲型副伤寒沙门菌MLST为ST85型,乙型副伤寒沙门菌MLST为ST86型;所有菌株均携带毒力岛SPII~SPI5代表基因ineA siC ,seL ,sifA ,mgrC ,ii ,sopB和调节基因phoP,甲型副伤寒沙门菌还携带三聚体结构的伤寒毒素( cytolethal disten-ding toxin ,CDT)基因citB pltA ,plB,毒力质粒基因pefA prot6E ,spwB检测均为阴性。结论﹐甲型和乙型副伤寒沙门菌同时传播具有致病性强及环丙沙星药物敏感性差的特点,应引起临床及实验室的高度关注。
2024, 42(05):384-388.
摘要:摘要:目的探讨人工阅读DL-Bt64血培养系统不典型生长曲线在鉴别血培养假阴性标本中的临床应用价值。方法将常见的生长曲线分为I~Ⅲ型,并以盲种培养法作为判定真阴性和假阴性的“金标准”。选取2180瓶经全自动血培养仪判读为阴性的静脉血培养物标本,通过分析采血量和患者的抗生素应用史,探讨不典型生长曲线及假阴性的形成原因。进一步采用A(抽取培养物,涂片并革兰染色)和B(人工阅读并分析各种不典型生长曲线)两种方法筛查假阴性标本,通过比较两种方法的敏感性,特异性、准确率和阳性预测值,评估方法B的临床应用价值。结果﹐2180瓶培养物中,用“金标准”方法共检出110瓶假阴性标本,其余2070瓶为真阴性标本。99.09%(109/110)的假阴性标本的生长曲线不典型,且97.27%(107/110)的不典型生长曲线与采血量不符合要求或滥用抗生素有关。79.09%的假阴性标本生长曲线延迟抬头,符合Ⅲ型。方法A与“金标准”方法结果完全一致。方法B筛选出140瓶疑似假阴性标本,经“金标准”方法确认,109瓶为假阴性,31瓶为真阴性;其余2040瓶标本经“金标准"方法确认,l瓶为假阴性,2039瓶为真阴性。方法B的敏感性(99.09%)和特异性(99.95%)与方法A相比差异无统计学意义(X值分别为0.90和2.01,P>0.05)。方法B的准确率(98.53%)和阳性预测值(77.86%)显著低于方法A(X值分别为32.13和54.23,P<0.01)。结论绝大多数假阴性标本的生长曲线不典型,与采样量不符合要求或抗生素滥用有关。通过人工阅读细菌生长曲线,能够高效筛选假阴性标本。
2024, 42(05):389-391.
摘要:
2024, 42(05):395-398.
摘要:
2024, 42(05):399-400.
摘要: