摘要:摘要：宏基因组测序技术在微生物检测与研究领域的应用迅速发展，为感染性疾病诊断、公共卫生监测及传染病防控提供了坚实的支持。然而，该技术在本地化应用进程中尚面临试剂审批、全流程质量控制、数据分析、报告解读以及运营成本等方面问题。该文就上述主要方面，根据实际经验结合国内外参考文献，提出相应的解决方案，以供同行参考。

摘要:摘要：随着疾病诊断相关分组（DRG)/病种分值付费（DIP)医改的全面推进，医疗服务模式与付费机制发生深刻变革。临床微生物实验室作为感染性疾病病原学诊断与治疗的重要支撑，其能力建设面临新的机遇与挑战。该文深入探讨DRG/DIP医改对临床微生物实验室的影响，分析当前实验室能力建设存在的问题，并就学科建设、人才培养、技术提升、信息化建设和临床沟通等方面提出针对性的加强策略，旨在提升临床微生物实验室在新医改环境下的综合能力，更好地服务临床诊疗与提升医疗质量。

摘要:摘要：目的分析碳青霉烯类耐药肠杆菌属（CREb)不同菌种之间的毒力差异，为CREb感染的致病机制研究与个体化治疗提供理论依据。方法共纳入2013年至2022年间临床分离的9株CREb菌株，涵盖5个种属：阴沟肠杆菌、霍氏肠杆菌、神户肠杆菌、阿氏肠杆菌和川大肠杆菌。通过全基因组测序分析毒力基因谱，并开展体外生长曲线、生物膜形成能力、血清杀菌实验及蜡螟感染模型等多项毒力表型实验。结果毒力基因分析显示，与细菌运动相关的毒力因子数量最多（16~20个），营养/代谢相关因子（10~12个)次之，侵袭因子最少，仅有2株阿氏肠杆菌携带ibeB基因。同种菌株的毒力基因谱相对一致，川大肠杆菌携带的毒力基因最少。体外生长实验显示，霍氏肠杆菌和阴沟肠杆菌生长速度最快，川大肠杆菌和神户肠杆菌较慢，阿氏肠杆菌生长最慢。生物膜实验结果显示，霍氏和阴沟肠杆菌生物膜形成能力最强，神户肠杆菌最弱。血清杀菌实验中，霍氏和阴沟肠杆菌存活率最高（>70%），川大肠杆菌存活率最低(<1%）。大蜡螟模型中，阿氏和阴沟肠杆菌表现出显著剂量依赖的毒力，而其他菌株毒力较弱。结论不同CREb菌种在毒力基因携带和表型表现方面存在显著差异。CREb的致病潜力为后续感染防控和治疗策略提供了基础数据支持。

摘要:摘要：目的探讨血清细胞因子和外周血C反应蛋白（CRP)在肺结核合并其他细菌及真菌感染的诊断效能。方法选取上海交通大学医学院附属松江医院肺结核病例作为研究对象（肺结核组，n=101），通过痰液/支气管肺泡灌洗液（BALF）微生物培养联合呼吸道病原体靶向高通量测序（tNGS)，将其分为肺结核合并细菌及真菌感染组（感染组，n=37)、肺结核未合并细菌及真菌感染组（非感染组，n=64)，以及体检健康者45例作为对照组。采用化学发光法检测血清细胞因子可溶性白介素-2受体(sIL-2R)、白介素-2(IL-2)、白介素-6(IL-6)、干扰素-y(IFN-y)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平，并收集肺结核组患者临床资料以及CRP等实验室指标数据。采用Mann-WhitneyU检验筛选具有差异的指标，二元Logistic回归分析肺结核合并其他细菌及真菌感染的影响因素，并采用受试者工作特征（ROC)曲线评估其检测效能。结果肺结核组患者血清sL-2R、IL-6、IFN-y和TNF-α高于对照组，IL-2低于对照组，差异有统计学意义（P均

摘要:摘要：目的基于临床症状、体征和常规实验室多项指标联合建立儿童细菌性脑膜炎（BM)鉴别诊断模型。方法回顾性分析2018年10月至2023年8月期间深圳市儿童医院诊治的192例急性脑（膜）炎患儿的临床资料，其中BM90例，病毒性脑（膜)炎102例。采用单因素分析两组患儿临床特征和实验室检查指标差异，采用多因素Logistic回归分析建立儿童BM鉴别诊断模型，通过受试者工作特征曲线（R0C)评价其对BM的鉴别诊断效能。另选取2023年9月至2025年4月期间75例急性脑（膜）炎患儿资料对该模型进行初步验证。结果BM组患儿年龄、呕吐比例低于病毒性脑（膜）炎组，差异具有统计学意义（P<0.05)，余临床症状和体征两组间差异无统计学意义(P>0.05)。血白细胞计数(B-WBC)等13项实验室指标两组间差异均有统计学意义(P均

摘要:摘要：目的探讨炎症复合指标C反应蛋白-三酰甘油-葡萄糖指数(CII)对女性类风湿关节炎（RA)合并泌尿系统感染的诊断价值。方法随机选取2023年1月—2025年7月江苏省中医院收治的76例女性RA合并泌尿系统感染患者为感染组，78例女性RA未合并感染患者为未感染组；统计感染患者检出病原菌，比较两组患者炎症复合指标CTI水平，采用受试者工作特征(ROC)曲线分析复合指标对RA患者合并感染的诊断价值。结果76例老年RA合并泌尿系统感染患者共培养出79株病原菌，主要为革兰阴性菌。感染组白细胞计数（WBC)、C反应蛋白(CRP)、CII、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)、全身炎症指数(SII)、泛免疫炎症值(PIV)均高于未感染组(P

摘要:摘要：目的了解呼吸道病原体感染的流行特征，为呼吸道感染诊治提供可靠依据。方法纳入2023年11月—2024年10月15328例呼吸道感染患者的鼻咽拭子样本，采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测甲型流感病毒（FluA)、乙型流感病毒（FluB)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒（ADV)、人鼻病毒(HRV)和肺炎支原体（MP)6项呼吸道病原体核酸。比较不同年龄、性别、来源患者病原体感染类型和检出率，分析单一感染及混合感染情况。结果15328例鼻咽拭子样本中FluA、FluB、RSV、ADV、HRV、MP的检出率分别为5.0%、3.9%、4.4%、11.3%、10.8%和11.2%。FluA在12月份检出率最高，达33.1%；ADV在6月份检出率达28.7%；RSV在2月份检出率为12.9%；MP在11月份检出率最高，达23.7%。各病毒不同性别间检出率差异无统计学意义(P均>0.05)，门诊与住院患者间检出率差异有统计学意义(P<0.05)。ADV主要感染3~5岁（占22.3%)和6~17岁年龄组（占23.5%），RSV主要感染1~2岁婴幼儿（占13.0%），而MP则以6~17岁学龄期和青少年期为主（占27.2%）。单一病原体感染5512例（占35.9%），双重、三重感染分别为648例（占4.2%)和53例（占0.3%）。结论6种病原体的检出率在不同季节、不同年龄组存在明显差异，且以单一病原体感染为主。根据当地病原体流行病学特点，可为临床预防及诊治提供可靠依据。

摘要:摘要：目的探究乳腺癌阿霉素（adriamycin,ADR)耐药细胞分泌的细胞外囊泡(extracellular vesicles，EVs)对肿瘤微环境相关血管内皮细胞的调控作用及其分子机制。方法体外构建乳腺癌敏感细胞株（MCF-7)及其ADR耐药株（MCF-7-ADR)，通过试剂盒法提取细胞上清液EVs；采用PKH67荧光标记示踪技术验证人脐静脉内皮细胞（humanumbilicalveinendothelialcell，HUVEC)对EVs的内吞作用；通过集落形成试验、划痕试验及成环试验系统评估EVs对HUVEC增殖、迁移及血管生成能力的影响；Western blot 检测CD31蛋白质的表达水平；ELISA法检测细胞上清液血管内皮生长因子（vascularendothelialgrowth factor，VEGF)的表达水平；基于微小RNA(microRNA，miRNA)测序技术筛选耐药细胞分泌的EVs中差异表达的miRNA。结果与敏感株相比，耐药株分泌的EVs显著增强HUVEC的增殖能力（集落数增加了38.7%，P=0.011)、迁移能力(划痕愈合率提高了42.3%,P=0.004)及成环能力(4h和16h管状结构形成率分别增加了1.8倍和2.3倍，P值分别为0.044和0.010)。Westerm blot检测结果显示，与敏感株相比，耐药株分泌的EVs的CD31表达水平增加了1.85倍(P=0.039)；ELISA法检测结果显示，VEGF的表达水平增加了2.12倍(P=0.012)。miRNA测序鉴定出差异表达的miRNA表达谱。结论乳腺癌ADR耐药细胞通过分泌富含特定miRNA的EVs，显著增强血管内皮细胞的增殖、迁移及血管生成功能，其机制可能与EVs介导的CD31/VEGF蛋白表达上调相关，提示耐药细胞通过EVs重塑肿瘤血管微环境，可能成为乳腺癌化疗耐药的新治疗靶点。

摘要:摘要：目的探讨乙型肝炎病毒(HBV)感染不同阶段患者树突状细胞（DC)功能变化，并分析其功能障碍机制。方法从GEO数据库下载单细胞RNA测序数据集GSE182159,根据感染阶段分为健康对照(HC)组、免疫活动(IA)组和免疫耐受(IT)组。选取IA和IT患者各7例以及同期12例体检健康者采集外周血，使用流式细胞术筛选经典树突状细胞（cDC)和浆细胞样树突状细胞(pDC)，实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测cDC和pDC转录因子表达水平。使用R语言和Python语言进行生物信息学分析。结果IA组和IT组的DC占比高于HC组。功能富集分析显示，IA组cDC的差异基因主要富集于炎症反应、MHCI抗原加工与提呈、细胞迁移、信号传递、代谢及免疫反应，IT组富集强度较低且干扰素反应显著下降。IA组pDC差异基因富集于MHCI抗原提呈、Fc受体信号转导和代谢，而IT组仅富集于Fc受体信号转导及代谢，且强度更低。两组pDC对I、I型干扰素的合成均下调，IT组下调更为显著。细胞通信分析显示，IA组髓系细胞除pDC外，与T细胞的通信增强；IT组cDC和pDC与T细胞的通信则下降。转录因子分析发现，STAT2、STAT3、IRF1、IRF5在IA组高表达，而在IT组表达较低；BHL-HE40在IT组cDC和pDC中普遍高表达。qRT-PCR结果与单细胞转录因子分析结果一致。结论乙型肝炎IT期是cDC功能障碍的关键时期，其MHCI抗原提呈、代谢及干扰素反应被显著抑制。pDC功能抑制较cDC更早发生，在IA期即表现出干扰素合成能力显著下调。

摘要:摘要：目的探究芒柄花黄素对表皮葡萄球菌分选酶A（SrtA)及其生物膜的抑制作用。方法收集产生物膜表皮葡萄球菌标准菌株RP62A及产生物膜表皮葡萄球菌临床菌株，采用倍比稀释法研究芒柄花黄素对表皮葡萄球菌最低抑菌浓度（MIC)；酶标仪绘制生长曲线研究不同浓度芒柄花黄素对表皮葡萄球菌的体外生长抑制作用；细胞培养测定芒柄花黄素细胞毒性；溶血试验研究芒柄花黄素生物相容性；荧光共振能量转移（FRET)试验测定芒柄花黄素对SrtA活性的抑制效果；纤维连接蛋白结合试验评估芒柄花黄素对表皮葡萄球菌结合纤维连接蛋白能力的影响；免疫荧光染色评估芒柄花黄素对表皮葡萄球菌富含丝氨酸的重复蛋白（SRRPs)锚定的影响；结晶紫染色法测定芒柄花黄素对表皮葡萄球菌生物膜形成的影响。结果芒柄花黄素对表皮葡萄球菌的MIC均大于512μg/mL。与对照组比较，32μg/mL芒柄花黄素未明显影响表皮葡萄球菌的生长；未降低人主动脉内皮细胞存活率；对人红细胞溶血率低于5%；对SrtA活性抑制率约为53.8%；降低了约45.4%的表皮葡萄球菌对纤维连接蛋白的结合能力；显微镜观察表皮葡萄球菌SRRPs的锚定减少趋势明显；可抑制约41.7%的表皮葡萄球菌生物膜形成。结论芒柄花黄素可以抑制表皮葡萄球菌的SrtA活性，降低其对纤维连接蛋白的结合能力，抑制其生物膜形成，有望成为抗表皮葡萄球菌感染抑制剂。

摘要:摘要：目的运用生物信息学方法筛选与急性缺血性卒中(acuteischemic stroke，AIS)相关的枢纽基因及信号通路，探寻潜在生物学标志物，以期为AIS的机制研究提供新证据。方法从GEO数据库（geneexpression omnibus)中获取AIS患者及健康人对照的基因表达数据集GSE37587,通过limma包筛选差异表达基因（differentiallyexpressedgenes,DEGs，|log,FC|>1.2，FDR

摘要:摘要：目的构建和验证区分恶性胸腔积液（MPE）和良性胸腔积液（BPE）的预测模型。方法选取2020年7月至2022年5月于南京医科大学附属淮安第一医院住院诊断存在胸腔积液（PE)的患者428例，依据诊断标准将患者分为BPE组(211例）和MPE组(217例)，收集患者基本信息和临床资料，采用Boruta方法进行单变量筛选，随后利用多因素Iogistic回归构建基本列线图的模型，采用bootstrap法对模型进行内部验证以评估列线图的性能，包括区分度、准确度和临床适用度。结果模型包含了8个关键变量，包括呼吸困难、胸痛、一般症状、有恶性肿瘤征像的X线/CT、血清癌胚抗原、血清神经特异性烯醇化酶、胸腔乳酸脱氢酶和胸腔癌胚抗原。内部验证显示模型R0C曲线下面积（AUCR0C)值为0.933(95%置信区间：0.912~0.954)，同时模型表现出良好的准确性(P>O.05)，决策曲线分析（DCA)显示，使用该预测模型预测MPE发生风险时，在概率阀值>1%的范围内具有显著的净收益。结论构建的预测模型能有效区分MPE和BPE。

摘要:摘要：目的分析南通市哨点医院门急诊感染性腹泻患者病原体分布特征，为防控策略提供依据。方法收集2022—2024年南通市4家哨点医院1966份腹泻病例粪便样本，进行肠道致病菌分离培养与生化鉴定、血清分型、PCR确认，运用PCR-荧光探针法进行肠道病毒核酸的鉴定与分型。结果共检出病原体565份，总检出率为28.74%，患者总感染率为25.69%。细菌以致泻大肠埃希菌和沙门菌为主，病毒以诺如病毒和轮状病毒为主。2022年病原体检出率低于2023年和2024年。春季总检出率最高，达46.56%。4~5月和7~8月细菌总检出率超8%，3月和4月病毒总检出率分别为50.00%和48.41%。主要感染群体为15岁以下儿童。不同居住环境间致泻大肠埃希菌、沙门菌、诺如病毒、肠腺病毒及总检出率差异有统计学意义（P均<0.05)。结论感染性腹泻病原体分布复杂多样，有年度差异，春季高发；优势菌群和病毒明显，有年龄、职业和居住环境特征。应加强卫生防控，提高疫苗接种率。

摘要:摘要：报道2例嗜二氧化碳大肠埃希菌致尿路感染病例。使用质谱仪和全自动细菌鉴定药敏分析仪Vitek2Compact对该菌进行鉴定。纸片扩散法药敏结果显示：2株菌株对头孢曲松和左氧氟沙星耐药，对哌拉西林/他唑巴坦和美罗培南敏感。细菌16SrDNA测序及耐药基因、多位点序列分型（MLST)结果显示：2株大肠埃希菌分别为ST44和ST1193，均含有耐药基因blacrxmm。提示嗜二氧化碳大肠埃希菌可导致有一定基础疾病的人群发生尿路感染且可对多种抗菌药物耐药。

摘要:摘要：通过人类基因组拷贝数变异测序（CNV-Seq)及染色体核型分析1例低比例嵌合特纳综合征胎儿出生前后细胞遗传学改变，为临床遗传咨询提供依据。孕18周羊膜腔穿刺术后CNV-Seq提示胎儿X染色体拷贝数减少，45，X0占比约11%；羊水核型为45,X[12]/46,XX[52]。产时脐血细胞核型为:45,X[4]/46,XX[95]；胎盘胎儿面、母面组织45,X单体嵌合比例分别为76%、56%；出生后3、6及12个月外周血细胞染色体核型分别为45,X[4]/46,XX[92]、45,X[3]/46,XX[90]及46,XX。无超声异常的低比例嵌合型特纳综合征胎儿妊娘结局可能良好，且45，X单体细胞系在出生后逐渐减少至消失。